昆明植物研究所分子生物學實驗中心是國家重大科學工程“中國西南野生生物種質資源庫”和國家科技部“國家重要野生植物種質資源庫”的重要支撐平臺之一。于2007年成立，現已建成“一室兩庫”（分子生物學實驗室、DNA庫和植物離體庫），具有完備的分子生物學實驗裝備和20多名專業技術支撐服務人員。中心占地約1500平方米，擁有200多臺／套通用分子生物學實驗設備，其中包括一代、二代和三代DNA測序儀、多重基因分析系統、激光共聚焦顯微系統、流式細胞分選儀和超速離心機等，總值約3000萬元。中心在植物分子標記，DNA條形碼，基因組、流式細胞術和資源組培再生等技術上有一定特色和優勢，目前正發展植物功能基因組和轉錄組等技術，中心定位為公共、開放實驗平臺，歡迎有需求的科研人員前來開展相關實驗研究和交流。 

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